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優(yōu)秀博士學術成果系列展示(四)

發(fā)布時間 :2019年12月09日 編輯 :賈麗 瀏覽量 :

段志光教授團隊在《情報計量學》發(fā)表文章基于網(wǎng)絡拓撲驅動的藥物新價值發(fā)現(xiàn)”

2018年8月,,國際《情報計量學》雜志(Journal of Infometrics, IF=3.484)上發(fā)表了段志光教授課題組的題為“Topology-driven trend analysis for drug discovery”(基于網(wǎng)絡拓撲驅動的藥物新價值發(fā)現(xiàn))的研究成果。課題組博士生呂艷華為該論文第一作者,。

本文采用機器學習和文本挖掘的方法,,基于文獻中藥物復雜網(wǎng)絡的拓撲結構關系,對現(xiàn)有自閉癥治療藥物及其關系進行重新審視,,發(fā)現(xiàn)潛在的藥物價值,,以期為自閉癥藥物治療及試驗研究提出科學的藥物假設。為此,,本文在PubMed數(shù)據(jù)庫中收集了所有自閉癥治療相關的科研論文,,基于MeSH術語提取與自閉癥治療密切相關的145種藥物及其6624個同義詞建立藥物網(wǎng)絡,,并基于相同的ATC分類層次建立疾病治療網(wǎng)絡,,以期從中發(fā)現(xiàn)潛在的疾病藥物關系。本文結合了共詞網(wǎng)絡,、社區(qū)探測,、弱組分、基于路徑發(fā)現(xiàn)的治療組分析,,以及檢測團內(nèi)重要藥物相互作用的方法等多種方法和技術,,提出了一種新的數(shù)據(jù)驅動型拓撲網(wǎng)絡發(fā)現(xiàn)方法開展舊藥新價值研究。研究結果表明,,對基于文獻的藥物網(wǎng)絡中所提取藥物及其關系的深入分析,,可以為藥物新價值發(fā)現(xiàn)研究提供新思路。結果還表明,,有四種藥物未來有可能用于自閉癥治療(Tocilizumab, Tacrolimus, Prednisone和Sulfisoxazole),,值得在實驗室進一步研究,并正式評估其對癥狀的可能影響,,這可能為心理學家,、醫(yī)生和研究人員提供基于數(shù)據(jù)的科學假說。

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