基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院解軍團隊揭示共同參與神經(jīng)管畸形和神經(jīng)外胚層來源腫瘤發(fā)生的基因及潛在機制
神經(jīng)管畸形(Neural tube defects,NTDs)是胚胎發(fā)育過程中,神經(jīng)管閉合發(fā)生障礙而引起的一種常見的先天性出生缺陷疾病,。在絕大多數(shù)脊椎動物中,,中空的神經(jīng)管是由神經(jīng)外胚層細胞增殖,、內(nèi)陷并最終離開外胚層表面而形成,。在人類的各類腫瘤組織中,有一類腫瘤同樣也是來源于早期胚胎的神經(jīng)外胚層,,包括6種:原始神經(jīng)外胚層瘤(Primitive Neurotodermal Tumour),、神經(jīng)膠質(zhì)瘤(Glioma)、膠質(zhì)母細胞瘤(Glioblastoma),、成神經(jīng)細胞瘤(Neuroblastoma),、神經(jīng)鞘瘤(Neurilemmoma)和髓母細胞瘤(Medulloblastoma)。其中,,膠質(zhì)母細胞瘤(GBM)是較常見且致死率極高的腦部腫瘤,。
研究基于RA誘導(dǎo)的NTDs鼠胚RNA-seq高通量測序數(shù)據(jù)及小RNA測序數(shù)據(jù)、人NTDs樣本芯片表達譜數(shù)據(jù),、GEPIA數(shù)據(jù)庫GBM腫瘤測序數(shù)據(jù)及DisGeNET等其他公共數(shù)據(jù)庫的開放數(shù)據(jù)開展研究,。挖掘和鑒定了NTDs發(fā)生過程中、GBM腫瘤發(fā)生發(fā)展過程中的差異基因,,對部分篩查獲得的“失控表達”基因分別在miRNA水平和蛋白水平進行了驗證,。篩選到了2個在NTDs及GBM腫瘤中共享的表達趨勢一致的失控基因,并預(yù)測了可能與其靶向結(jié)合小分子藥物及其對接位點,。篩選出了4個在NTDs及神經(jīng)外胚層來源腫瘤中共享的基因,,并探索了這些基因可能存在的分子機制,為胚胎早期發(fā)育和腫瘤發(fā)生發(fā)展的關(guān)系研究提供新的思路,。
與FGF1基因靶向結(jié)合的小分子藥物結(jié)合示意圖
部分研究結(jié)果近日以“Analysis of genes associated with both neural tube defects and neuroectodermal tumors”為題發(fā)表于Medical Science Monitor上,。山西醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院博士生曹睿為第一作者,基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院劉志貞教授,、趙虹副教授,、解軍教授為共同通訊作者。