山西醫(yī)科大學(xué)附屬山西省眼科醫(yī)院孫斌教授課題組開展基于高通量測序技術(shù)及培養(yǎng)組學(xué)的眼鼻咽部微生物菌群研究取得新進(jìn)展
由于眼部、鼻部及口咽部在解剖學(xué)上相通，故比較中國人群健康和疾病狀態(tài)下眼,、前鼻孔和口咽的微生物群落,，揭示不同人群眼鼻咽部微生物菌群的生物學(xué)信息,。
高通量測序結(jié)果顯示健康人眼部和鼻部的微生物群落組成相似,，與口咽部不同,。本研究通過高通量測序技術(shù)共獲得38個(gè)門,，94個(gè)綱,，215個(gè)目,，386個(gè)科，744個(gè)屬,。培養(yǎng)組學(xué)及分離株基因組研究結(jié)果顯示,眼鼻咽部分離培養(yǎng)獲得的26個(gè)菌屬和55個(gè)菌種中,，眼部和鼻部表皮葡萄球菌分離率最高，口咽部唾液鏈球菌分離率最高,。ANI和Blast比較發(fā)現(xiàn)溶血性葡萄球菌,、金黃色葡萄球菌及表皮葡萄球菌在眼鼻咽三個(gè)部位基因組相似性高。
圖1健康人眼鼻咽部微生物菌群Beta多樣性（PCA）：屬水平
研究表明,，高通量測序技術(shù),、培養(yǎng)組學(xué)和單菌株全基因組測序方法相結(jié)合，可較為完整地提供眼鼻咽部微生物群落“屬”,、“種”水平分類學(xué)特征,。建立重點(diǎn)菌種的培養(yǎng)、鑒定和全基因組信息比較技術(shù)體系,，可實(shí)現(xiàn)眼部及鄰近部位菌種的精準(zhǔn)溯源,。為今后探討眼鼻咽部感染性疾病的發(fā)病機(jī)制、預(yù)防和新型微生態(tài)治療提供參考,。
