基礎醫(yī)學學科是山西省唯一的基礎醫(yī)學博士學位授權點,，擁有省內最優(yōu)秀的基礎醫(yī)學科研團隊,，長期以來一直開展基礎醫(yī)學理論和應用研究，圍繞食管癌發(fā)生機理,、心肌缺血性疾病,、肝臟纖維化,、糖尿病,、心腦血管病藥物、干細胞等方向開展研究,。目前形成了人體生理與病理生理學,、再生醫(yī)學、病理學,、人體解剖與組織胚胎學,、基礎藥理與分子藥理學、醫(yī)學信息學等六個穩(wěn)定的研究方向,。

2016年以來學科主持國家級科研項目48項,、省部級科研項目51項，發(fā)表SCI論文130篇,，專利,？項，獲得省部級科研成果獎7項,。公開發(fā)表的學術論文中,，圍繞神經退行性疾病藥物治療的機制研究,、代謝紊亂相關心血管疾病的多種機制研究、心肌再生的基礎與臨床研究,、食管鱗癌遺傳變異的分析鑒定及癌變機制研究,、健康醫(yī)療大數據應用及精準醫(yī)學等研究領域，形成了多篇標志性學術成果,。其中以國家百千萬工程人選,、教育部“新世紀優(yōu)秀人才”、山西省青年三晉學者,、“三晉英才”高端領軍人才崔永萍教授帶領的團隊,，依托“食管癌發(fā)病機理及轉化研究”山西省重點實驗室和山西省科技創(chuàng)新重點團隊，圍繞我國特色,、山西高發(fā)的食管鱗癌,，聚焦于食管鱗癌早篩、早診標記物和食管癌驅動基因作用網絡研究方向,，利用多組學,、細胞生物學和分子生物學技術與手段，在食管癌發(fā)生發(fā)展中關鍵基因的作用及其功能研究基礎上,，取得了系列原創(chuàng)成果,。據Web of Science數據，近五年在全球食管癌遺傳變異分析領域最有影響力的人員中,，本學科貢獻達17%,，排名第5。

學科于2016年獲批國家級實驗教學示范中心,，成為區(qū)域一流的基礎醫(yī)學教學和研究平臺,。另外為了滿足科研需求，于2019年底在中都校區(qū)建成占地8000平米的基礎醫(yī)學研究中心為學科的未來發(fā)展提供了有力支撐,。